1999년 6월 삼성SDS 연구원 출신 이해진이 한국어 검색을 목표로 네이버컴을 세웠다(Wikipedia). 2000년 7월 김범수의 한게임과 합병해 이듬해 NHN으로 사명을 바꾸고 게임 수익으로 검색 R&D를 키웠다. 2002년 10월 사용자 Q&A 서비스 지식iN을 내놓고, 이를 앞세워 2003년 야후코리아를 제치고 국내 1위 포털에 올라 이후 20년 넘게 검색 시장을 지배했다(Wikipedia).
2011년 6월 NHN재팬이 메신저 라인을 출시해 1년 만에 약 5천만 명을 모으며 일본·대만·태국을 석권했고, 2016년 7월 라인은 뉴욕·도쿄 동시 상장으로 11억 달러 넘게 조달해 그해 최대 기술 IPO를 기록했다(TechCrunch).
2023년 8월 자체 대규모언어모델 하이퍼클로바X와 챗봇 클로바X를 공개했다(TechCrunch). 2024년 일본 총무성이 데이터 유출을 빌미로 라인야후에 네이버 의존도 축소를 행정지도하며 지분 매각 압박이 거셌으나, 네이버는 단기 매각을 하지 않기로 했다(The Register).