1968년 Capital International이 비미국 시장을 위한 글로벌 주식 시장 지수를 처음 출판했다. 1986년 모건 스탠리가 그 지수의 라이선스 권한을 얻어 MSCI 브랜드를 내놨고, 1988년 신흥 시장을 다룬 최초의 포괄적 지수인 MSCI Emerging Markets Index가 나왔다.
2004년 위험 관리·포트폴리오 분석 회사 Barra를 약 8억 1,640만 달러에 인수해 MSCI Barra를 세웠다. 2007년 모건 스탠리에서 분사해 소수 지분을 상장했고, 2009년 남은 지분까지 정리되며 완전히 독립했다. 2010년 RiskMetrics Group을 약 15억 5천만 달러에, 2014년 GMI Ratings를 인수해 위험과 ESG 분석을 붙였다.
2018년 신흥 시장 지수에 중국 A주를 편입하기 시작했고, 2020년 ARK Invest와 메가트렌드 지수 5종을 냈다. 2025년 매출은 31.3억 달러로 9.75%, 순이익은 12억 달러로 8.40% 늘었다. 2026년에는 물리적 기후 위험 데이터 회사 First Street를 1억 2천만 달러에 인수했다.