2000년 리처드 맥베이가 J.P. 모건의 'Lab Morgan' 프로그램에서 나온 모델을 바탕으로 MarketAxess를 독립 벤처로 세우고 2,400만 달러를 유치했다(Wikipedia). 2001년 Trading Edge를 인수했고, 2004년 11월 주당 11달러에 500만 주를 발행하며 나스닥에 상장했다.
2012년 모든 참가자가 익명으로 거래하는 Open Trading을 내놓아 유동성을 키웠고, 2013년 유로클리어에서 Trax를 4,200만 달러에 인수해 유럽 기반을 다졌다. 2018년 미국 투자등급 채권 점유율 22.8%로 정점을 찍은 뒤 TradeWeb과의 경쟁으로 점유율이 내려가기 시작했다.
2019년 LiquidityEdge를 1억 5천만 달러에 인수해 국채 시장에 들어갔고, 2020년 팬데믹 기간 거래량과 주가가 급등했으며 도이체뵈르제의 규제 보고 사업부를 인수했다. 2023년 크리스 코내넌이 CEO로 오르고 Pragma를 인수했다. 2025년 매출 8억 4,600만 달러로 10% 성장했으나, 2026년 1분기 매출이 12% 늘어 2억 3,340만 달러가 되고도 주가는 52주 최저치에 근접했다.