1983년 David E. Shaw가 수의학 진단 키트와 기기를 만드는 IDEXX Laboratories를 세우고 가금류 산업에서 시작했다(FundingUniverse). 1991년 나스닥에 상장해 진단 플랫폼과 영업망을 넓힐 자본을 확보했고, 1993년 식수 오염 물질을 잡는 수질 테스트 제품, 1994년 수의사 대상 상업 실험실 검사 서비스로 영역을 넓혔다. 1997년에는 수익 증가가 급격히 둔화됐다.
2002년 창업자에 이어 Jonathan Ayers가 회장 겸 CEO로 취임했고, 2008년 창업 25년 만에 연간 매출 10억 달러를 넘겼다. 2013년 FTC의 독점금지법 문제 제기로 주요 유통업체와의 독점 계약을 해지하기로 합의했다.
2018년 ezyVet과 Animana를 인수해 클라우드 진료 관리 시스템을 확보했고 2021년 ezyVet 인수를 마무리했다. 2019년 Jay Mazelsky가 CEO로 취임했고, 2020년 ProCyte One 혈액학 분석기, 2022년 수질 기업 Tecta, 2024년 슬라이드 없는 세포 분석기 inVue Dx와 보호자 참여 소프트웨어 Vello를 더했다. 2025년 매출은 약 43억 달러였고, 2026년 5월 12일 Michael Erickson이 CEO로 취임했다.