1997년 치아 교정에 기술을 쓰겠다는 목표로 Align Technology가 설립됐고, 1999년 보이지 않는 교정 장치 시장을 연 인비절라인을 출시했다. 2001년 주당 13달러에 나스닥에 상장했고, 2002년 공동 창업자 Zia Chishti가 CEO에서 물러나 Thomas M. Prescott이 취임했으며 특허 소송도 이때부터 시작됐다(Dental Tribune). 2003년 첫 연간 흑자를 냈다.
2006년 경쟁사 OrthoClear를 상대로 낸 특허·영업비밀 소송을 합의하며 그 지식재산권을 2천만 달러에 사들였다. 2011년 iTero 구강 스캐너 사업부를 인수했고, 2017년 3Shape를 상대로 6건의 특허 소송을 냈다. 2019년 iTero Element 5D, 2020년 exocad 인수와 소아용 인비절라인 퍼스트, 2024년 iTero Lumina로 제품을 넓혔다.
2021년 본사를 애리조나 템피로 옮기고 2분기 매출이 처음 10억 달러를 넘었다. 2023년 SmileDirectClub 관련 반독점 집단소송에 걸렸고 2025년 3,170만 달러 수정 합의가 법원 승인을 받았다. 같은 해 중국 Angelalign을 상대로 전 세계에서 소송을 냈고, 2026년 유럽 예비 금지 명령 항소심에서 이겼다.